蛋白质组学TCPA数据集使用记录

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f_dedup_IQR

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tcpa <- read.csv('tmp/TCGA-PRAD-L4.csv')
type <- as.numeric(substr(tcpa$Sample_ID, 14, 15))
tcpa <- subset(tcpa, type < 10) # tp
rowNa <- substr(tcpa$Sample_ID,1, 12)
tcpa <- f_dedup_IQR(tcpa[-(1:4)],rowNa)
tcpa

后续可以用limma包进行差异分析


蛋白质组学TCPA数据集使用记录
https://b.limour.top/2006.html
Author
Limour
Posted on
September 4, 2022
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